古基因组研究发现中国北方一支已灭绝且深度分化的老虎支系

老虎手绘图（陈瑜 绘）
（神秘的地球uux.cn报道）据地大新闻网（记者 陈华文）：7月27日，中国地质大学（武汉）赖旭龙教授领导的因组研究古DNA团队与吉林大学、丹麦哥本哈根大学合作完成的发现“古基因组研究发现中国北方一支已灭绝且深度分化的老虎支系”研究成果，在著名学术期刊《英国皇家学会会刊B辑：生物科学》发表。中国支已支系这是北方世界首例古虎基因组研究成果。
2003年，灭绝吉林大学考古团队在吉林省通化市大安镇的且深一处溶洞中，发掘出大量古生物化石，度分并将其中部分斑鬣狗化石提供给我校古DNA研究团队开展合作研究。老虎通过对化石中残存DNA的古基分析鉴定，研究人员意外发现其中一块残破的因组研究下颌骨（标本编号：CADG482）并非斑鬣狗，而是发现属于老虎（以下简称“大安虎”），其年代已经超过了43500年。中国支已支系

吉林通化大安溶洞古虎化石
在生物学分类上，老虎属于猫科、灭绝豹属、虎种，是大型猫科动物中的“明星”，其演化历史、生存状态均受到社会和学界的广泛关注。当前的老虎主要包括六个地理亚种：西伯利亚虎（东北虎）、华南虎、印支虎、孟加拉虎（印度虎）、马来虎、苏门答腊虎。已有研究认为，它们均分化自一个距今约11万年的祖先种群。
为探究大安虎与现生老虎各地理亚种的亲缘关系，研究人员加大了对大安虎下颌骨化石的古DNA提取及二代测序文库构建等工作，从24个测序文库中，组装得到大安虎近完整的线粒体基因组及部分核基因组信息。基于大安虎和所有现生老虎遗传成分对比分析及系统发育树构建，发现大安虎不同于任何现生老虎，属于此前未知且现已灭绝的遗传支系，它所代表的遗传支系与现生老虎的祖先，在约26万年前就已分道扬镳。与现生老虎的祖先随后在各地辐射分化形成不同地理亚种不同，大安虎代表的遗传支系，随后走上了绝灭之路。

老虎演化历史的科学图示
a) 老虎母系有效种群动态变化； b) 老虎线粒体系统发育关系
对于现生老虎的研究，只能揭示它们直系祖先的演化历史。大安虎基因组的测定和解析，表明在老虎的演化历程中，有部分遗传支系丢失了，所有现代老虎只是其中一个支系的后代。迄今为止，最古老的老虎化石发现于我国甘肃距今超过200万年的早更新世，其它中、晚更新世的虎化石也遍及东亚。研究人员表示：“在得到古DNA数据之前，消失的老虎支系的遗传信息，一直被尘封在破碎的、易被误读的化石中，古基因组研究使得绝灭的老虎支系重见天日，为系统全面地探究老虎的演化历史提供了必要的、不可替代的分子依据。”（原标题：为大安虎存在和灭绝提供科学证据 我校研究团队破解世界首例古代老虎基因之谜）
相关报道：地大团队发现已灭绝的老虎支系 距今4.35万余年
（神秘的地球uux.cn报道）据湖北日报（记者 张歆 通讯员 陈华文）：7月29日，记者从中国地质大学（武汉）（以下简称“地大”）获悉，该校赖旭龙教授领衔的古DNA（古基因组研究）团队发现了一支已灭绝的老虎支系，距今4.35万余年，研究人员根据样品采集地点将其命名为“大安虎”。
现存于世的老虎主要包括六个地理亚种：西伯利亚虎（东北虎）、华南虎、印支虎、孟加拉虎（印度虎）、马来虎、苏门答腊虎。已有研究认为，它们均分化自一个距今约11万年的祖先种群。
研究人员使用古DNA方法研究发现，大安虎的祖先种群与现生老虎的祖先种群在约26万年前就已分道扬镳。与现生老虎的祖先随后在各地辐射分化形成不同地理亚种不同，大安虎代表的遗传支系，随后走上了绝灭之路。这意味着老虎的演化历程中，有部分遗传支系丢失了。
记者了解到，迄今为止，最古老的老虎化石发现于我国甘肃，距今超过200万年，存在于早更新世，其他中、晚更新世的虎化石也遍及东亚。古虎化石的发掘并不鲜见，为何老虎遗传支系的研究成果却很少？
地大古生物学与地层学教授盛桂莲介绍，DNA存在于生物的所有细胞中，揭示了生物的遗传信息。但化石中的古DNA很难得，在低温、干燥、碱性土壤等适当条件下，化石才可能含有微量和高度碎片化的古DNA。在得到古DNA数据之前，消失的老虎支系的遗传信息，一直被尘封在破碎的、易被误读的化石中。古DNA研究使得绝灭的老虎支系重见天日，为系统全面地探究老虎的演化历史提供了必要的、不可替代的分子依据。
据悉，此研究成果也是世界首例古虎基因组研究成果，与吉林大学、丹麦哥本哈根大学合作完成，在学术期刊《英国皇家学会会刊B辑：生物科学》上发表。

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